法國《查理周刊》大屠殺怵目驚心，冷血槍手不但奪走漫畫作者等人的性命，更攻擊文明世界核心價值——言論自由，暴行受到舉世譴責，從法國到全球各個角落都有示威，舉目皆見「我是查理」的標牌，恐怖襲擊不僅無法嚇倒人們，反而激起大家同仇敵愾。然而不可忽視的是，恐怖分子已播下猜忌疑懼的種子，法國恐怕掀起新一輪反回潮。

《查理周刊》在巴黎的辦公室遭到血洗，使一些充滿爭議的課題再掀辯論，譬如言論自由和對個人或宗教的尊重，兩者之間應該如何平衡，無冕皇帝們是否只要法律容許，便可恣意對人對事進行嘲諷或挑釁？這次傳媒機構遇襲，也暴露保安漏洞，類似軟目標要防範襲擊，可謂防不勝防。其實，《查理周刊》主編由於曾收死亡恐嚇，獲警方派員貼身護駕，饒是如此，他仍難逃過一劫，最終連警察保鏢也成陪葬品。此外，歐美澳這些西方國家擔憂的「聖戰士」定時炸彈，似乎正一個個爆炸開來。

法國另有更大隱憂。在屠殺發生後，社會主流展示團結一致對抗暴行的決心，但欲蓋彌彰的是對回教徒的敵意。槍手在行兇時以阿拉伯語高呼「真主偉大」，宣稱替受褻瀆的先知穆罕默德報仇，雖然理智告訴人們，這只是極端分子所為，與大多數和平的回教徒無關，這甚至是恐怖分子假宗教之名而行的罪惡，不過，法國回教徒恐怕要受池魚之殃。

法國是歐洲回教徒最多的國家，在全國六千五百萬人中有五百萬回教徒，這拜其曾在中東和非洲擁有殖民地，又尊尚「自由博愛平等」來者不拒所賜，加上法國「原居民」出生率低，兩三代下來，回教徒比例大增，衍生不少社會問題。

回教徒第二三代在法國出生，能說一口純正流利法語，就像屠殺案阿爾及利亞裔疑兇兄弟般，但這個族群並不被主流所接納，能爬到社會上層的屬鳳毛麟角，在飽受歧視和邊緣化下，歷年騷亂不斷，薩爾科齊在當內政部長時就遇過這類騷亂，靠鐵腕鎮壓贏得支持而後來選上總統。

在滋事外，不見出路的年輕回教徒，更成極端組織招募的新血，疑兇兩兄弟似是人辦，據報他們曾欲往中東打聖戰，從犯案手法的專業來看，明顯受過嚴格訓練。屠殺案難免使回教徒更受誤解和敵視。