「港台經濟文化合作協進會」由行政會議成員李業廣任主席，三名曾出訪台灣的政策局長政制及內地事務局局長林瑞麟、商務及經濟發展局局長劉吳惠蘭和民政事務局局長曾德成，則分別擔任常務副主席和另外兩個副主席。其他理事多為公營機構高層，包括金融管理局總裁陳德霖、貿易發展局總裁林天福和旅遊發展局總幹事劉鎮漢等。另一行會成員中大校長劉遵義則擔任顧問。

避免雙重徵稅

協進會以有限公司模式運作，但經港府授權後可與台灣對口單位「台港經濟文化合作策進會」直接商討公共政策，模式類似中國海協會與台灣海基會，令兩地可就航運、金融、避免雙重徵稅和醫療衞生等有更深層的交流。曾俊華稱，港台兩地官員可以利用「協、策」兩會的平台、以適當身份溝通和合作，進一步提升至高層交流。

協進會之下，還成立「香港—台灣商貿合作委員會」，由已故國民黨將軍張學良的姪孫、全國政協委員李大壯擔任主席，與台灣策進會之下的「經濟合作委員會」對口，負責在民間及商界層次，就經貿、投資和旅遊合作展開交流。

時事評論員劉銳紹批評：「香港官員嘅思維，（根本）唔了解香港作為中國與台灣關係嘅潤滑劑作用！」他指出，內地城市與台灣的合作都發展得快過香港，如上海市多年前已與台北市舉行「雙城論壇」，兩地市長亦曾互訪。