鼻咽癌倘若能夠及早發現然後利用放射治療，以高能量射線將癌細胞消滅，會有不錯的存活率。但由於鼻咽位處鼻腔盡頭，在頭顱的中間，四周布滿重要器官和神經，後面是脊髓神經，上面是腦幹和腦下垂體，前面是眼睛，兩側是中耳，所以在放療過程中，可能同時波及其他健康組織，引發長期後遺症，例如當口腔內唾液線受損，會令患者的唾液減少，口腔酸鹼度由弱鹼變成酸性，牙齒容易變壞。此外，放射治療也會令患者的頸部及下頜關節的肌肉硬化，影響活動。醫生會建議患者多做口部運動，及定時往牙科診所檢查。放射治療亦可能損害中耳，引致中耳炎，影響聽覺，而鼻咽癌化療藥物「順鉑」（Cisplatin）亦會影響聽力，約一半同時接受化療及放療的患者的高音聽力受損，故此患者接受治療後應保持耳朵清潔，以免污水滲入，減少耳朵受細菌感染的機會。
放射治療亦會令皮膚、喉頭、口腔內軟組織及締結組織容易有細菌性發炎，所以患者接受放療後應提高警覺，若發現皮膚有輕微紅腫或疼痛，可能是皮膚炎先兆，應通知醫生，以靜脈輸注抗生素，否則可能引致敗血病，倘若細菌入侵氣管更會令氣管腫脹及引致咽喉炎。
放射治療也會影響內分泌腺體，包括甲狀腺及腦下垂體，前者受損會令甲狀腺素數量下降；如果後者功能失調，則會令男性賀爾蒙、腎上腺素等分泌減少，患者應服食相關的賀爾蒙補充劑，以維持身體的正常運作。
然而，上述的長期後遺症往往於放療後數年才浮現，到時患者的警覺性已減低，察覺不到問題，因此患者必須定期覆診。一般建議患者放療後第一、二年，應最少每隔二至三個月覆診一次，讓醫生監察病情，預防癌症復發及治療相關後遺症。 臨床腫瘤科專科醫生周倩明