把美軍基地遷出沖繩，寫進了以民主黨為首的執政聯盟政綱中，社民黨一直威脅，如果鳩山不履諾，就會退出執政聯盟，在鳩山周日親臨沖繩表明「不得不拜託讓普天間基地遷至邊野古」後，社民黨召開緊急會議，商討對策，黨內出現分歧，退留兩派各持己見，福島瑞穗沖繩之行，將決定該黨去向，從她把鳩山批得體無完膚不留餘地來看，社民黨可能去意已決，執政聯盟面臨分裂。鳩山領導的民主黨，雖在眾議院佔多數，但在參議院，卻須依賴社民黨和國民新黨兩個夥伴。

鳩山說，天安艦爆炸沉沒，顯示日本周邊環境存在很多不穩定因素，不能削弱駐日美軍包括海軍陸戰隊的力量。他又辯解，當前朝鮮半島和整個亞洲局勢，反映日美互信的穩固關係至關重要，因此他下定決心落實日美二○○六年協議，把普天間美國海軍陸戰隊基地，照計劃搬到名護邊野古沿岸地區。無論鳩山是真心這樣想，或僅借天安艦過橋，可以說，安全威脅確是大條道理，可以說服大多數日人，使其諒解鳩山在搬遷美軍基地上的出爾反爾。沖繩保留美軍基地，沖繩人怒怨沖天，反觀日本本土尚算平靜，可見天安艦事件發揮了咕作用，卸減不少政治震盪，否則鳩山面臨的國內壓力將會更大。

鳩山遵守日美協議，備受華府讚賞，美國國務卿希拉妮讚揚他具有勇氣，作出艱難但正確的選擇，不過鳩山要落實基地搬遷，困難重重，沖繩人誓言抗爭到底，指罵鳩山「背叛」的沖繩知事仲井真弘多和名護知事稻嶺進，都力拒保留美軍基地，鳩山面對的，不但是一場場示威，更有地方政府的杯葛。名護新美軍基地的興建，無論機場跑道還是建築物，依照日本法例，皆須獲地方政府批准，仲井真弘多和稻嶺進大可運用權力與中央對抗到底。

但沖繩與中央之戰，鳩山或能置身度外。處理美軍基地搬遷，盡顯鳩山的無能和民主黨的幼稚，七月參議院選舉，民主黨難逃被唾棄的命運，鳩山也難再戀棧下去，他的下台，可能就是這幾個月的事了。