天主教神父性侵案愈揭愈多，幾乎日日都有新發現，從歐洲的愛爾蘭、德國、奧地利、瑞士到大西洋彼岸的美國、巴西等，範圍愈擴愈廣，一宗比一宗聳人聽聞。教會被指奉行「沉默」傳統文化，千方百計遮掩醜事敗行，死死維護名聲，威信岌岌可危。

在這場大風暴中，本篤十六世可說身處風眼，在一九八一年至二○○五年即位教宗前，身為拉辛格樞機主教的他，擔任教廷信理部部長，負責教會紀律，無論是愛爾蘭還是美國神父侵童事件，他都被指知悉內情。愛爾蘭性侵案，四名主教引咎請辭，他只准一人辭職；美國威斯康辛州神父墨菲在學校性侵逾二百聾童，是他接納墨菲求情，網開一面，未把墨菲交由當地司法機關處置，使罪犯逃過法網，得享天年，可憐公義埋沒，受害者幾十年後憶說往事仍驚懼顫慄。從這兩例子可見當年的信理部部長似乎一味大事化小，小事化了，以教會名聲為重，他甚至被指在○一年向全球大主教下達命令，就是上報教廷的神父不正當行為案須對外界三緘其口。

性醜聞鬧翻天，教宗口說把事件看作對整個教會及他自己的考驗，但外界看到的，卻是梵蒂岡像刺蝟般，豎起全身毛刺自衞。教廷指摘傳媒惡意中傷，點名批評美國《紐約時報》有關墨菲事件的報道，觀點不平衡，大有與傳媒一戰之勢。有分析認為，教廷視傳媒為敵人，並不明智，反而應視之為諍友，傳媒的壓力，正好是推動教會改革的力量之一。

一連串性醜聞，已動搖不少教徒對天主教會的信心，有報道指有信眾拒絕向神父告解，因為誰看來都有「犯罪」嫌疑。不過，更多人態度包容，認為神父亦是凡人，難免犯錯，教會應該進行改革，檢討制度規條，例如禁慾是否適宜等。