兩國無機直飛歐洲

歐盟引用國際民航組織（International Civil Aviation Organization）的評估指出，菲律賓對航空公司的安全規管嚴重不足，蘇丹的航空部門也在安全問題上表現差強人意。歐盟委員會亦對去年涉及嚴重飛行事故的伊朗航空公司（Iran Air）作出業務限制，只准它使用某些航機飛往歐洲。

兩國共有五十二間航空公司，其中菲律賓有四十間，蘇丹則有十二間。目前兩國都沒有航班直飛歐盟成員國，但黑名單或會令歐盟公民對這些公司的航班卻步，增加它們改善安全措施的壓力。歐盟每年最少更新黑名單四次。