鍾南山去年十一月曾公開質疑官方公布的豬流感死亡個案，被不少人稱讚膽子大。他前日說：「我根本不是膽子大，而是手上有事實證據。」他表示，全國都有他的學生，他們治療多少病人，有些甚麼症狀，他心中有數。

對於內地近期的毒奶粉回流醜聞、海南毒豆角風波，鍾南山笑言他最近反而敢吃豆角，因相信進入市場的肯定經過嚴格檢測，「但是過一段時間，我又不敢吃了！」他指，毒豆角等食品安全問題凸顯「多頭管理」的體制缺陷。以豆角為例，生產歸農業部門管，到市面又變成食品歸質監部門管，銷售歸工商單位管理，出口歸檢疫局，多個環節容易出現監管漏洞。