馬英九連任國民黨主席的得票率逾九成，國民黨有選舉權的黨員約三十八萬人，儘管投票率約六成，問題是只有馬英九一位候選人，投票率和得票率意義都不大。馬英九連任黨主席後，馬上面臨明年七合一選舉，若然敗選，他是否負疚請辭？

馬英九連任之後，中共總書記習近平第一時間發出賀電，指出兩岸關係站在新的起點上，面臨重要機遇；兩黨實當順應世界發展之大勢，良性互動，繼續推動兩岸關係全面發展，拓寬兩岸關係和平發展道路，並使兩岸關係不斷前行。習近平的賀電語調平和，並無逼馬英九加快進行政治和談，只是強調和平發展。

馬英九也在第一時間回電，稱一九九二年，海峽兩岸達成「各自以口頭聲明方式表達堅持一個中國原則」的共識；國民黨自五年前在台灣重返執政伊始，相關部門立即在此項「九二共識」的基礎上，恢復兩岸中斷近十年的和解與合作，迄今已簽署十九項協議；雙方關係的大幅改善，對促進兩岸和平與繁榮，提升兩岸人民福祉，貢獻甚大。馬英九強調「一中各表」，顯然是修正早前吳伯雄訪京提出的「一個中國架構」，因吳回台後即受綠營炮轟。對於未來兩岸關係，馬英九也只是強調「繼續擴大與深化兩岸的交流合作」，對政治和談避而不談。

事實上，反對馬英九連任黨主席的聲浪不少。在他的辦公室主任賴素如被控涉嫌雙子星案遭收押後，國民黨內的反對聲浪更加強烈，而焦點不是他的用人，也不是馬英九團隊的施政，而是反對他再競選連任國民黨主席。面對國民黨內及社會輿論對馬英九兼任黨主席並有意參選連任提出質疑，他回應說自己參選黨主席的決定不變，而他一向主張的「以黨輔政」也要比以前更有力道。

明年敗選 終須退位

馬英九決定不放棄黨權，表面的理由是「以黨輔政」，但相信馬英九是擔心在他和其團隊民望不斷走下坡的態勢下，再失去國民黨主席一職，可能會提前跛腳，更加失去黨內同志支持，甚至失去相當多依靠黨內議員對其施政保駕護航的影響力，最嚴重的是完全失去對二○一六年政權保衞戰的主導權。

問題是，多種觀察都認為，明年七合一選舉國民黨敗選可能性極大，一旦敗選，馬英九按台灣倫理還是要辭黨主席，那時他的處境更為困難。