慘劇發生至第三天，當局仍未交代是否涉及調度失誤、系統失靈等問題，令網民議論紛紛。由於官方調查緩慢，有網民開玩笑留言說：「溫州事故原因有新進展：鐵路調度系統界面不兼容IE6，警方已拘留了兩名無證界面開發人員。」
該則留言經輾轉流傳，有版本變成是「甬溫線鐵路兩名調度員被拘」，溫州市公安局新聞發言人沈強昨否認消息。不過，有鐵路部門人士私下分析，調度應對不及時是列車追尾的可能原因之一，因此網民的揣測亦有根據，但具體肇因尚要等官方公布。