ABS-CBN電視台引述消息報道，對阿基諾三世當選總統有功的內閣兩大派系「薩馬派」（Samar）和「巴萊派」（Balay）一直爭權不休，他們在人質危機當日溝通不足，令政府和警方間失去協調，不知誰是總指揮。菲國警隊以往多由內政部長負責，因這個職位有足夠權力向不同部門要求協助，但新政府基於薩馬派和巴萊派協議，改由內政部副部長普諾管轄警隊，而普諾是薩馬派出身，內政部長林炳智則屬巴萊派。兩人被指因派系對立致溝通不足，拯救行動最終慘不忍睹。

「電話門」露端倪

薩馬派因阿基諾競選時總部位於奎松巿薩馬街而命名，派系以執行部長奧喬亞為首，他是阿基諾三世的好友，巴萊派則由另一批阿基諾三世競選支持者組成。兩大派系欠缺協調亦從「電話門」爆出不同版本可知一二，對於阿基諾三世事發當日未有接聽曾蔭權電話，巴萊派指總統當時正在開會，所以不知對方致電；薩馬派卻指總統知道來電。

內鬥情況傳遍菲國，總統府昨日否認有關指控。總統府發言人陳顯達稱，負責治安事務的內政部副部長普諾管轄全國警隊，一早清晰知道他負責處理相關危機，而內政部長林炳智則負責各地方政府事務。陳顯達強調兩人並無鬥爭，亦無內閣派系之爭。林炳智前日接受電視台訪問時稱：「若最後指出我要為事件負責，你不會再見到我在辦公室內。」