現時本港不少醫院、大廈及商場均使用大型中央冷氣系統，不過，醫院的中央系統較為特別。為保持衞生，醫院冷氣系統除設多重過濾設備，更裝置高效能過濾及消毒設備，務求令室內空氣更純淨，減低醫護人員患病機會。
不過，中央冷氣系統始終有其缺點。由於冷氣貫穿各層，甚至各幢大樓，冷氣槽較狹長，不易清潔，除非利用機械及用長時間清潔，否則無法徹底消毒，反而孳生細菌。
在非典型肺炎期間，「沙士」病毒更懷疑透過中央冷氣加速傳播。當年在威爾斯醫院爆發「沙士」初期，部分醫科學生因毫不知情，而進入受感染的「源頭病人」病房考試，學生即使與病人全無接觸，甚至保持十五呎距離，仍不幸受感染。有學者便估計，因病房濕度低，令載有病毒水氣化成更小的粒子，經空氣四散傳播，中央冷氣系統便成為廣泛播毒的「元兇」。