協議生效前，印尼公司在香港開設的分行所賺取的利益，要全數分別在香港及印尼課稅。協議生效後，印尼公司在香港所繳的稅款，可以在印尼徵收的稅款中抵免。

例二：僱員

香港居民在印尼工作的入息，如僱主並非印尼人或公司，及在當地總逗留時間在十二個月內不超過一百三十八日，便毋須在印尼繳稅，同樣情況適用於印尼居民在香港的收入。

例三：航空運輸及航運收入

協議生效前，香港的航空公司在印尼賺取的利潤需要在印尼交稅。協議生效後，香港航空公司的利潤在印尼免稅，只需在香港交稅。

例四：間接或被動收入

協議生效後，香港居民在印尼收取的股息收入、利息及特許權使用費等需預繳的稅率均會調低。

註1.九個與香港簽訂或達成避免雙重徵稅的國家：日本、汶萊、荷蘭、印尼、奧地利、法國、匈牙利、愛爾蘭和列支敦士登。

註2.各國避免雙重徵稅的優惠各有不同。