手術治療適用於中下段食道的癌瘤，切走的範圍包括癌瘤，以及附近上下各五公分的食道，因此創傷性甚大，而病人需要接受食道重整手術，利用胃或腸臟取代食道。醫生也會根據病人狀況選用一種或混合多種治療方法，以取得最佳的治療效果。例如一些腺性食道癌的病人可以接受「三文治」式治療，即先接受術前化療，縮細癌瘤後再做手術，然後再接受術後輔助化療，進一步殺滅癌細胞，減低轉移性復發的機會及提升病人的存活率。

健康欠佳忌綜合治療

假如病人的身體狀況並不適合做手術，或想保留食道，可以同步放化療取代手術，以控制病情及維持病人的吞食功能。各地的經驗顯示，病人接受同步放化療的療效與手術治療相若。綜合大型的國際研究結果，若患者於術前先進行同步放化療，然後作全食道切除有助達至最佳的根治率，比術前只做引導性化療為佳，但要留意，只有整體健康狀況理想的患者，方可考慮接受放化療和手術的綜合治療。

如腫瘤已擴散，或屬於復發個案，亦有不少治療方案。現時治療食道的化療藥物方案主要是ECF或DCF，即Epirubicin或多西紫杉醇（Docetaxel）結合順鉑（Cisplatin）及5-FU。至於較新的組合則以草酸鉑（Oxaliplatin）取代順鉑；卡培他濱（Capecitabine）取代5-FU，藉以減低毒性及相關的副作用，部分病人亦可用CPT11和治療胃癌的S1藥物，以控制癌瘤惡化。另外綜合國際研究，具餓死癌細胞效能的標靶藥物，及單克隆抗體 （如患者的表皮生長因子受體「HER2」呈陽性），對於治療有癌腫擴散的食道癌患者具良好療效。