但無論如何，脂肪瘤可分為良性、低度惡性、中度惡性及高度惡性，當中以良性最多，且不會由良性轉為惡性。然而，一般人難以分辨脂肪瘤是否屬於惡性，通常需要靠醫生臨床檢驗，以確定脂肪瘤的屬性，通常長在皮下脂肪組織的脂肪瘤，大部分屬於良性；如果深入肌肉層，或是在肌肉下的組織，屬於惡性的機會增加。此外，磁力共振也經常被用作檢查脂肪瘤，它能夠分辨中及高度惡性的脂肪瘤，但對低度惡性脂肪瘤的敏感度較低，患者或需再進行抽取細胞組織，或是切片細胞組織化驗才能確定。

惡性須切除

不同性質的脂肪瘤的處理方法並不相同，例如當發現良性脂肪瘤時，可以進行定期觀察；至於惡性脂肪瘤，無論是低、中或高度惡性，都必須以手術進行廣泛切除，不單只腫瘤本身，連周邊的一些健康組織也可能需要切掉，因為惡性腫瘤始終有擴散及復發的危險。倘若發現脂肪瘤在短時間內迅速脹大，及有疼痛及麻痹感覺，有可能不是良性脂肪瘤，患者需要接受磁力共振等進一步檢查。