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真正的先天性「陰陽人」極為罕見，由於母親排卵時同時分泌兩種染色體，令胎兒出生後同時有一個卵巢和一個睾丸，因嬰兒沒有明顯陰莖，長大後要以手術重建陰莖極之困難，兒科專科醫生吳國強稱，醫生多會建議「當女仔咁養」，以手術切除睾丸及服用女性賀爾蒙補充劑。
性徵不明顯需驗基因
吳國強表示，另一種情況就是嬰兒出生後性徵不明顯，要檢驗遺傳基因，XY染色體代表男孩子，XX則為女孩子。但如嬰兒有XY染色體但沒有陰莖及睾丸，即體內男性賀爾蒙反應不足，醫生會建議父母「當女仔咁養」，嬰兒需做手術將藏在腹腔內的睾丸切除，否則長大後有機會變成癌症。
如性徵不明顯的嬰兒驗出染色體為XX，代表是女孩子，但陰核很長、陰道較深色，即嬰兒的腎上腺分泌賀爾蒙有問題，產生很多男性賀爾蒙，嬰兒會血壓低及經常嘔吐，腎臟流失鹽分，嚴重者會休克及死亡，需要接受類固醇治療。
不過中文大學兒科學系副教授韓錦倫指出，若性徵不明顯的男嬰能及早被發現是男兒身份，可做手術將藏於腹腔的睾丸帶回陰囊。至於因賀爾蒙影響而導致貌似男嬰的女嬰，多是由於第六條染色體出現問題，需要補充女性賀爾蒙。韓錦倫指，這些性徵不明顯的個案多在出生後頭一個月確診，需要兒科、內分泌、外科、遺傳科等多個專科跟進。