機身容易彎曲變形

iPhone 6 Plus機身僅七點一毫米厚，且用較柔軟的鋁合金打造，機身頂部及中間受壓下，會輕易彎曲變形。有用家把手機放入後褲袋，駕車約十八小時，回家後發現螢幕倒影怪異扭曲，驚覺手機變彎。

毛髮被機身夾到

iPhone 6用戶表示，在打電話時，頭髮或鬍子曾經夾在玻璃跟鋁合金之間的狹縫，一撮撮毛髮被扯出來，讓人感到不舒服及疼痛。

更新作業系統後出現問題

有iPhone 6和6 Plus的用戶表示更新了iOS8.0.1作業系統後，無法打電話，亦有人稱無法使用指紋識別系統。美國有應用程式技術管理公司曾指iOS 8令應用程式有逾百分之三時間出現故障。不少人投訴facebook App持續停頓。