• 供認犯罪的自書材料和親筆供詞係在辦案人員的壓力下形成，應作為非法證據予以排除。

•薄谷開來係本案關鍵證人，但作證能力存疑，又未到庭接受質證，證言不應採信。

•薄谷開來關於曾告訴他接受徐明出資購買法國別墅等證言虛假，他對上述情況均不知情。

•在主觀上沒有故意貪污，客觀上也沒有同意王正剛將公款給他補貼家用的提議，王正剛等證言內容虛假。

•在涉案工程款撥付時已調任遼寧省省長，不再兼任大連市的職務，沒有貪污涉案工程款的職務便利。

•打王立軍耳光、調整王立軍職務行為，不是導致谷開來殺害英商海伍德案不能依法及時查處，以及王立軍叛逃的重要原因。

•一審判決認定他濫用職權情節特別嚴重係因王立軍叛逃，但量刑卻重於王立軍犯叛逃罪所判處的刑罰，主次顛倒。