有親綠媒體形容，回顧○三年沙士疫情肆虐期間，時任台北市長的馬英九，面對疫情亦進退失據，市立和平醫院率先遭病毒攻陷，進而全台失守。媒體的評論或未及中肯，但對於當前的救災、防疫，馬政府確存在眾多不足之處。

「五百條人命換不下一個閣揆？」

台灣大學政治系主任王業立說，馬政府當前應作三方面調整：首先在內閣加入經過民意洗禮的成員；其次是行政上加強中央與各部會，及地方之間協調。而最重要的是，馬英九必須直接領導，親自協調軍事、外交等事務，才有機會重拾民心、重建管治威信。

文化大學企管系教授江岷欽亦認為，現在政府就責任不清楚，內閣必須要全面改組，以示負責。「民進黨時代，八掌溪事件四條人命換下了時任行政院副院長游錫堃，現在五百條人命難道換不下一個閣揆嗎？」