土耳其人與維吾爾族同屬突厥後裔，同樣信奉回教。在鄂圖曼帝國時代，土耳其向新疆派遣教師傳播泛突厥思想。現時多個疆獨組織亦以土國為基地，包括被中國列為恐怖組織的東突厥斯坦解放組織。中國維族與漢族○九年在新疆發生血腥衝突時，土國反應激烈，總理埃爾多安更指中國政府種族滅絕維吾爾人。