改革開放，鄧老爺子趕華國鋒下台，當上中央軍委主席，牢牢掌握軍隊後，中共迄今發生過三次「軍隊清洗」。

第一次是八九年「六四」事件，時任中共總書記、中央軍委第一副主席的趙紫陽得到部分軍隊的支持，反對北京戒嚴，武力鎮壓學生，例如「天下第一軍」三十八軍就公然抗命。六四平亂後，軍中同情、支持趙紫陽和民運的將領遭到清洗。

另一次是鄧小平九二年南巡後，中共召開十四大，「楊家將」被清洗，代表人物是中共元老、時任中央軍委常務副主席的楊尚昆，以及他的堂弟、時任中央軍委秘書長、總政治部主任的楊白冰。他們一直深受鄧老爺子信任，長期「代」鄧老爺子掌軍，在軍中勢力龐大。但據稱楊尚昆同情趙紫陽，對「六四」有不同看法，對江澤民當接班人不以為然，故鄧老爺子不能容他們，擔心自己「百年之後」，楊家將會「造反」或翻六四的案，於是下定決心讓楊尚昆徹底退休，楊白冰則調離軍隊，當了一屆空頭政治局委員，並啟用已經退居二線的老將張震、劉華清當軍委副主席，輔佐江澤民清洗「楊家將」在軍中的勢力。據軍中人士透露，那次清洗十分緊張，牽扯不少人，不亞於林彪事件後對「四野」的清洗。

當然，上述兩次「清洗」，都沒有像以前搞政治運動似的整人，沒有對外搞「革命大批判」，主要是人事調動。目前，第五代開始了第三次，由反貪腐、打掉了徐才厚這隻軍中大老虎觸發，據稱已涉及不少將官。