今年勞動節長假期結束之際，港府剛啟動健康申報措施，嚴防豬流感，不過當局卻未做好準備，除無派人派發健康申報表外，亦未有提供足夠鉛筆或原子筆供旅客填寫，以及沒有供應足夠的填表地方，令不少旅客被迫坐在地上或跪地填表，再加上宣傳不足，有旅客甚至因為不知道要填表，到過關前一刻要折返填表，更一度有過百人聚集填表，情況極混亂。

此外，當局雖然有派人員在ｅ道收集健康申報表，但是各通道人員的處理手法不一，有些通道要詳細核對身份證資料和表格，導致大排長龍，令在場人士甚為不滿；另一些通道的人員則只是望一望表格，沒有覆核，便放入收集箱。