陳水扁自二○○○年上台執政後，玉山官邸即成為「綠頂商人」的朝貢聖地。早在○二年，吳淑珍當上總統夫人後不久，就已傳出涉及SOGO百貨公司的股權爭奪案，多家企業為入主SOGO走後門。涉案的太平洋流通公司董事長李恆隆承認，曾把大批SOGO禮券送到總統府，並批評吳淑珍貪得無厭：「她以為她是西太后啊！」

涉及新竹科學園高價出售土地的龍潭購地案、並承認曾向扁家付錢的前中信金控副董事長辜仲諒，早前就大爆吳淑珍曾當着他面罵扁，罵到連辜也不好意思，被迫躲到廁所。洗錢案爆發後，檢方曾斥吳「大肆干政、搜括財物、紊亂體制、敗壞官箴」。

遇車禍癱瘓致心理扭曲

吳淑珍過去形象正面，父親為醫生，家境富裕。她當年不顧父母反對，與扁私奔並委身下嫁。到七九年美麗島事件後，她還鼓勵扁為民進黨前主席黃信介辯護。

曾有扁家友人分析，八六年吳淑珍為丈夫參選台南縣長拉票，不幸遇上車禍致半身癱瘓，令其心理漸漸扭曲，缺乏安全感。加上扁有感虧欠妻子，事事包容忍讓，讓吳淑珍慢慢成為干政橫蠻的西太后。